Sau khi Trần Phi Hùng công bố chia tay bạn đời sau nhiều lần tìm cách hòa giải rạn nứt mối quan hệ, đại diện của Lâm Khánh Chi là Bảo Quỳnh cho biết nữ ca sĩ mắc Covid-19 nên cần tập trung điều trị, chưa thể phản hồi về thông tin đổ vỡ.
Chồng ca sĩ Lâm Khánh Chi cho biết thêm, cả hai đã chia tay nhưng hết tình vẫn còn nghĩa. Vì vậy, dù đang ở Đà Lạt chụp ảnh cho công việc kinh doanh nhưng Trần Phi Hùng quay về lại Sài Gòn, đang ở chung để tiện chăm sóc Lâm Khánh Chi trong lúc này. Sau khi nữ ca sĩ khỏi bệnh sẽ ở riêng.
Phi Hùng và Lâm Khánh Chi nhiều lần "tan, hợp". Năm 2020, cả hai mâu thuẫn, Lâm Khánh Chi dọn về nhà mẹ đẻ sống. Sau đó, họ giảng hòa. Hồi đầu tháng 11, trên trang cá nhân, ca sĩ đăng ảnh bên ông xã kèm dòng trạng thái úp mở việc "đường ai nấy đi".
Lâm Khánh Chi về chung nhà với bạn đời vào tháng 12/2017 sau hơn một năm yêu nhau, được gia đình hai bên đồng thuận. Cả hai lên kế hoạch sang Thái Lan làm thụ tinh ống nghiệm, nhờ người mang thai hộ. Hai bên gia đình ca sĩ vui mừng khi đón bé Trần Huỳnh Thiên Long chào đời cuối năm 2018.
Cả hai mở cửa hàng kinh doanh thời trang ở TPHCM. Lâm Khánh Chi từng ra mắt tự truyện có tên Lột xác, kể về hành trình chuyển giới và những cuộc tình của cô. Anh Trần Phi Hùng - bạn đời cô - sinh năm 1985, quê gốc Nam Định và kinh doanh ở TPHCM.
Trước khi ly hôn, Lâm Khánh Chi thường chia sẻ cuộc sống hôn nhân hạnh phúc khi được bố mẹ chồng và ông xã kém 8 tuổi chăm sóc, yêu chiều, thường mua tặng cô những món đồ đắt đỏ.
Ca sĩ tên thật là Huỳnh Phương Khanh, sinh năm 1977 tại TPHCM, từng là ca sĩ được yêu thích những năm 1990 với nghệ danh Lâm Chí Khanh. Sau hai liveshow năm 2002, Lâm Chí Khanh "biến mất" khỏi làng giải trí. Năm 2012, ca sĩ thừa nhận đã chuyển đổi giới tính. Đầu năm 2016, cô đổi nghệ danh là Lâm Khánh Chi.