Nguyên nhân chủ yếu là do công tác giải phóng mặt bằng và thiếu nguồn vật liệu. Cụ thể, về công tác giải phóng mặt bằng, theo tổng hợp của Bộ Tài chính, hiện nay, dự án đã bàn giao mặt bằng với chiều dài tuyến 638,8km/652,86km (đạt 97,8%); hoàn thành 73/83 khu (đạt 87,9%); đang triển khai thi công 9 khu, phấn đấu hoàn thành trong quý III/2021.
Riêng đoạn Cam Lộ - La Sơn khả năng không hoàn thành đúng kế hoạch vào năm 2021 do một số nguyên nhân như bão lũ khu vực miền Trung năm 2020, dịch Covid-19, khó khăn trong nguồn vật liệu đất đắp và chậm trễ trong công tác giải phóng mặt bằng đối với những đoạn phải xử lý nền đất yếu.